O Museu Gama d’Eça, da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), foi criado em 23 de julho de 1968, pelo reitor José Mariano da Rocha Filho. Sua primeira sede foi na sala 5106, no térreo do prédio onde era o Centro de Ciências Pedagógicas (prédio 44), atual Centro de Ciências Rurais (CCR), no Campus da Universidade, em Camobi.
Em 28 de fevereiro de 1979, foi transferido para o prédio 21, também no campus. Em 10 de dezembro de 1981, a Sociedade União dos Caixeiros Viajantes do Rio Grande do Sul (SUCV) doou a coleção do Museu Victor Bersani para o Museu Gama d’Eça, mediante as condições de dar continuidade aos trabalhos desenvolvidos pelo mesmo. Tal coleção foi tombada pelo Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional (IPHAN) em 25 de março de 1938.
Em 7 de dezembro de 1985, o Museu Gama d’Eça e o Museu Victor Bersani foram transferidos para a sede atual, na rua do Acampamento nº 81, no centro de Santa Maria. A sede dos Museus é o Palacete, que foi a residência e o consultório médico do Dr. Astrogildo César de Azevedo. A edificação foi projetada e construída pelo escritório de engenharia de Rudolf Ahrons, sendo o projeto atribuído ao arquiteto alemão Theodor Wiederspahn. A execução da pintura artística interna, paredes e tetos é atribuída à Vunderleen e a porta principal de entrada foi esculpida por Antônio Marques de Carvalho.